ยุคกลาง
ไม่มีข้อมูลในหนังสือมากนักที่ระบุถึงประวัติศาสตร์ของฮอกวอตส์หลังจากการก่อตั้ง จนกระทั่งถึงราวห้าสิบปีก่อนการเข้าเรียนของแฮร์รี่ พอตเตอร์หลังจากก่อตั้งโรงเรียนได้ราวสามร้อยปี ได้เริ่มการประลองเวทไตรภาคี กับโรงเรียนเวทมนตร์ที่มีชื่อเสียงของยุโรปอีกสองแห่งคือ เดิร์มสแตรง และโบซ์บาตง การแข่งขันนี้ดำเนินไปเป็นเวลาหกศตวรรษ ก่อนจะหยุดไปเพราะยอดการเสียชีวิตที่สูง และเริ่มอีกครั้งในปีพ.ศ. 2537 ในแฮร์รี่ พอตเตอร์กับถ้วยอัคนี
ยุคใหม่
ฮอกวอตส์เสี่ยงต่อการถูกปิดถึงสองครั้ง ครั้งแรกในปีพ.ศ. 2485 เมื่อทอม ริดเดิ้ล ทายาทของสลิธีริน เปิดห้องแห่งความลับเมื่อเขาอยู่ปีห้า มีผู้เสียชีวิตหนึ่งคนเป็นเด็กผู้หญิงชื่อเมอร์เทิล กระทรวงเวทมนตร์ขู่ที่จะปิดฮอกวอตส์ เนื่องจากริดเดิ้ล ซึ่งอาศัยอยู่ในสถานเลี้ยงเด็กกำพร้าของมักเกิ้ล ไม่ต้องการให้ฮอกวอตส์ถูกปิด เขาจึงโยนความผิดให้รูเบอัส แฮกริด ทำให้แฮกริดถูกไล่ออกเมื่อแฮร์รี่อยู่ปีสอง ห้องแห่งความลับถูกเปิดอีกครั้งโดยจินนี่ วีสลีย์ ภายใต้อิทธิพลของไดอารี่ของริดเดิ้ล (หนึ่งในฮอร์ครักซ์ของโวลเดอมอร์) ความทรงจำของริดเดิ้ลควบคุมจินนี่ผ่านไดอารี่ และเปิดห้องแห่งความลับขึ้นเป็นครั้งที่สอง จินนี่ได้ไดอารี่ของริดเดิ้ลจากการที่ลูเซียส มัลฟอยแอบสอดไดอารี่ไว้ในหนังสือเรียนของเธอ โดยหวังว่าเธอจะถูกจับได้และกระทบไปถึงอาเธอร์ วีสลีย์ พ่อของเธอ รวมถึงกำจัดนักเรียนที่ไม่ใช่เลือดบริสุทธ์ให้หมดไปจากโรงเรียน อย่างไรก็ตาม แฮร์รี่ พอตเตอร์ค้นพบความจริง ทำลายไดอารี่และบาสิลิสก์ในห้องแห่งความลับ ทำให้ฮอร์ครักซ์หมดไปหนึ่งอัน
ในปีที่สี่ของแฮร์รี่ การประลองเวทไตรภาคีได้จัดขึ้นอีกครั้ง บาร์ตี้ เคราช์ จูเนียร์ ปลอมตัวเข้ามาเป็นอลาสเตอร์ มู้ดดี้ และใส่ชื่อของแฮร์รี่ในถ้วยอัคนีในฐานะโรงเรียนที่สี่ซึ่งไม่มีอยู่จริง เคราช์ช่วยเหลือแฮร์รี่ตลอดการแข่งขัน เพื่อให้แฮร์รี่ชนะ โดยเฉพาะในภารกิจสุดท้ายซึ่งเคราช์เปลี่ยนถ้วยไตรภาคีเป็นกุญแจนำทางสู่ลอร์ดโวลเดอมอร์ แฮร์รี่รอดมาได้ แต่โวลเดอมอร์สามารถคืนชีพเป็นผลสำเร็จจากเลือดของแฮร์รี่ รวมถึงทำลายเกราะป้องกันของแฮร์รี่บางอย่างด้วย
ในปีที่ห้าของแฮร์รี่ กระทรวงเวทมนตร์พยายามแทรกแซงฮอกวอตส์ผ่าน "กฤษฎีกาการศึกษา" หลายฉบับ โดยส่งโดโลเรส อัมบริดจ์เข้ามาเป็นอาจารย์วิชาการป้องกันตัวจากศาสตร์มืด เธอค่อยๆควบคุมฮอกวอตส์ผ่านกฤษฎีกาหลายฉบับ และเข้าแทนตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ในเวลาต่อมา หลังจากที่ถูกทำร้ายโดยเซ็นทอร์ในป่าต้องห้าม และคอร์ลิเนียส ฟัดจ์จำเป็นต้องยอมรับการคืนชีพของโวลเดอมอร์ อัมบริดจ์ถูกถอดออกจากโรงเรียน
ในตอนท้ายปีที่หกของแฮร์รี่ อาจารย์ใหญ่อัลบัส ดัมเบิลดอร์ถูกสังหารโดยเซเวอรัส สเนป อาจารย์วิชาปรุงยา มิเนอร์วา มักกอนนากัล ดำรงตำแหน่งรักษาการอาจารย์ใหญ่ ในปีสุดท้ายของแฮร์รี่ ฮอกวอตส์ถูกโจมตีโดยกองกำลังของโวลเดอมอร์ เมื่อเขาพบว่าแฮร์รี่อยู่ที่นั่น เหล่าคณาจารย์ ภาคีนกฟีนิกซ์ กองทัพดัมเบิลดอร์และนักเรียนที่บรรลุนิติภาวะแล้วร่วมต่อสู้ด้วย สงครามจบลงด้วยการตายของโวลเดอมอร์ และซากปรักหักพังของฮอกวอตส์ อย่างไรก็ตาม ฮอกวอตส์ยังคงเปิดสอนต่อไป ภายใต้การบริหารจัดการของมักกอนนากัล และเนวิลล์ ลองบัตท่อม ได้เป็นอาจารย์สอนวิชาสมุนไพรศาสตร์
ชั้นเรียน
นักเรียนชั้นปีที่หนึ่งและสอง จะเรียนวิชาเหมือนกันทั้งหมด ได้แก่- วิชาสมุนไพรศาสตร์ สอนการดูแลรักษาพืชวิเศษต่างๆ
- วิชาปรุงยา สอนการปรุงยาต่างๆที่มีผลทางเวทมนตร์
- วิชาแปลงร่าง สอนการเปลี่ยนสมบัติของวัตถุต่างๆ
- วิชาคาถา สอนคาถาต่างๆ เช่นการทำให้วัตถุลอยได้
- วิชาการป้องกันตัวจากศาสตร์มืด สอนเกี่ยวกับการป้องกันตัวเองจากศาสตร์มืดต่างๆ เช่นพ่อมดและสิ่งมีชีวิตด้านมืด ไม่มีอาจารย์คนใดที่เคยสอนวิชานี้ได้อยู่ในโรงเรียนเกินหนึ่งปี นับตั้งแต่ลอร์ดโวลเดอมอร์สาปวิชานี้เมื่อเขาถูกปฏิเสธ(แต่ใน แฮร์รี่ พอตเตอร์ กับเครื่องรางยมทูต เซเวอรัส สเนปได้เป็นอาจารย์ใหญ่หลังจากสอนวิชานี้ ซึ่งหลังจากที่แฮร์รี่กลับจากภารกิจ สเนปตายในตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ด้วยฝีมือของลอร์ดโวลเดอร์มอร์
- วิชาประวัติศาสตร์เวทมนตร์ เป็นวิชาที่น่าเบื่อเกี่ยวกับเหตุการณ์ต่างๆในประวัติศาสตร์ของโลกพ่อมด
- วิชาดาราศาสตร์ สอนเกี่ยวกับดาวและดาวเคราะห์ และผลที่มีต่อเวทมนตร์
ในปีที่สาม นักเรียนจำเป็นต้องเลือกวิชาเลือกอย่างน้อยสองวิชา จากวิชาต่อไปนี้
- วิชามักเกิ้ลศึกษา สอนการดำรงชีวิตของมักเกิ้ล
- วิชาการดูแลสัตว์วิเศษ เกี่ยวกับการดูแลสิ่งมีชีวิตเวทมนตร์ต่างๆ
- วิชาพยากรณ์ศาสตร์ สอนการทำนาย (หรือพยายามจะทำนาย) เหตุการณ์ในอนาคต
- วิชาอักษรรูนโบราณ สอนเกี่ยวกับตัวอักษรรูน ซึ่งเชื่อว่าเป็นภาษาเวทมนตร์ที่ตายไปแล้ว
- วิชาตัวเลขมหัศจรรย์ สอนเกี่ยวกับคุณสมบัติวิเศษของตัวเลข
อาจารย์และบุคลากร
อาจารย์ปัจจุบัน
- วิชาสมุนไพรศาสตร์ : โพโมนา สเปราต์
- วิชาปรุงยา : ฮอเรซ ซลักฮอร์น
- วิชาแปลงร่าง : มิเนอร์ว่า มักกอนนากัล
- วิชาคาถา : ฟิเลียส ฟลิตวิก
- วิชาการป้องกันตัวจากศาสตร์มืด : เซเวอร์รัส สเนป
- วิชาประวัติศาสตร์เวทมนตร์ : ศาสตราจารย์บินส์เป็นอาจารย์คนเดียวในโรงเรียนที่เป็นผี ชอบนำวิญญาณมาสอนหนังสือ
- วิชาดาราศาสตร์ : ศาสตราจารย์ซินิสตร้า
- วิชามักเกิ้ลศึกษา : แชริตี้ เบอเบจ
- วิชาการดูแลสัตว์วิเศษ : รูเบอัส แฮกริด
- วิชาพยากรณ์ศาสตร์ : ซีบิลล์ ทรีลอว์นีย์ และฟีเรนซี (แบ่งชั้นสอน)
- วิชาอักษรรูนโบราณ : ไม่ระบุ
- วิชาตัวเลขมหัศจรรย์ : ศาสตราจารย์เวกเตอร์
อาจารย์ในอดีต
วิชาการดูแลสัตว์วิเศษวิชาแปลงร่าง
วิชาปรุงยา
วิชาการป้องกันตัวจากศาสตร์มืด
- เซเวอรัส สเนป
- โดโลเรส อัมบริดจ์
- อลาสเตอร์ "แม้ด อาย" มู้ดดี้
- รีมัส ลูปิน จันทร์เจ้า คือฉายา เพราะเขาเป็นมนุษย์หมาป่า
- กิลเดอรอย ล็อกฮาร์ต
- ควีรีนัส ควีเรลล์ผู้มีใบหน้า2 ใบ ซึ่งใบหน้าข้างหลังเคยเป็นที่อาศัยของลอร์ด โวลเดอมอร์
- กัลเลเธีย เมอร์รี่ธ็อต
อาจารย์ใหญ่
- มิเนอร์วา มักกอนนากัล
- เซเวอรัส สเนป
- โดโลเรส อัมบริดจ์
- อัลบัส ดัมเบิลดอร์
- อาร์มันโด ดิพพิต
- ฟินิแอส ไนเจลลัส แบล็ก
- ดิลิส เดอร์เวนต์
- ศาสตราจารย์เอเวอราด
- ศาสตราจารย์ฟอเตสคิว
บุคลากรอื่น ๆ
- อาร์กัส ฟิลช์ : ภารโรง
- วิลเฮมมินา กรับบลี-แพลงค์ : อาจารย์วิชาการดูแลสัตว์วิเศษ (สำรอง)
- รูเบอัส แฮกริด : ผู้รักษากุญแจและคนดูแลสัตว์
- มาดามฮูช : อาจารย์วิชาการบินและกรรมการควิดดิช
- อ็อก : ผู้รักษากุญแจและคนดูแลสัตว์ (เกษียณแล้ว)
- เออร์มา พินซ์ : บรรณารักษ์
- ป็อปปี้ พ็อมฟรีย์ : พยาบาล
- เซเวอรัส สเนป : กรรมการควิดดิช (สำรอง)
- อะพอลเลียน พริงเกิล : ภารโรง (เกษียณแล้ว)
- วิลกี้ ทไวน์ครอส : อาจารย์สอนการหายตัว
- เซเวอรัส สเนป : อาจารย์ใหญ่ฮอกวอตส์ (ช่วงโวลเดอมอร์ยืดครองอำนาจในเล่ม 7)